Die BVVG ist eine dezentral strukturierte Gesellschaft des privaten Rechts, die eng mit dem die Fachaufsicht ausübenden Bundesministerium der Finanzen sowie dem Bundesministerium für Ernährung, Landwirtschaft und Verbraucherschutz zusammenarbeitet.
Die BVVG, die rund 770 Mitarbeiter beschäftigt, hat ihren Hauptsitz in Berlin. In größeren Städten der neuen Bundesländer gibt es acht Niederlassungen mit zehn Geschäftsstellen, die das operative Geschäft erledigen.
Mitglieder der Geschäftsführung sind Dr. Wolfgang Horstmann (Sprecher) und Dr. Wilhelm Müller sowie Hans-Joachim Bange, Generalbevollmächtigter. Vorsitzender des Aufsichtsrates ist Staatssekretär a. D. Dr. Walter Priesnitz.